Permanent bioinformatiker i jämförande och evolutionär genomik bei Uppsala Universitet

Permanent bioinformatiker i jämförande och evolutionär genomik

Publicerad: 2022-06-23
Uppsala universitet är ett brett forskningsuniversitet med stark internationell ställning. Det yttersta målet är att bedriva utbildning och forskning av högsta kvalitet och relevans för att göra långsiktig skillnad i samhället. Vår viktigaste tillgång är alla de individer som med sin nyfikenhet och sitt engagemang gör Uppsala universitet till en av landets mest spännande arbetsplatser. Uppsala universitet har drygt 54 000 studenter, mer än 7 500 anställda och en omsättning på cirka 8 miljarder kronor.
Institutionen för cell- och molekylärbiologi är en av de mest internationella, breda och framstående biomolekylära avdelningarna i Europa, som omfattar sju forskningsprogram som omfattar ämnen som bioinformatik, mikrobiologi och biofysik. Vi erbjuder nu en tillsvidaretjänst för att arbeta med avancerad bioinformatisk support inom ramen för National Bioinformatics Infrastructure Sweden (www.nbis.se) och SciLifeLab (www.scilifelab.se), med fokus på evolutionär och jämförande genomik, samt populationsgenomik. Arbetsplatsen är placerad vid SciLifeLab-noden i Uppsala. I den här kreativa miljön har NBIS mer än 50 bioinformatiker, systemutvecklare och data stewards placerade, tillsammans med flera andra SciLifeLab-enheter och forskargrupper.
Läs mer om våra förmåner och hur det är att jobba inom Uppsala universitet.
Dina framtida arbetsuppgifterDina uppgifter kommer att bestå i:
  • Avancerade bioinformatiska analyser inom forskningsprojekt i Sverige, inklusive deltagande i ett stort forskningsprojekt i barrträdsgenomik.
  • Utveckling av bioinformatiska verktyg och arbetsflöden.
  • Utbilda andra forskare i bioinformatik genom samarbeten i supportprojekt, undervisning på nationella kurser, och genom deltagande i olika nätverk.
  • Delta i det löpande utvecklingen av NBIS/SciLifeLab på en nationell nivå.

Dataanalys inom forskningsprojekt är den huvudsakliga uppgiften och kommer att genomföras i samarbete med forskargrupper vid svenska universitet eller industri. Arbetet kan sträcka sig från kortare analysuppgifter till djupa samarbeten inom stora nationellt prioriterade projekt, där du har det övergripande ansvaret för de bioinformatiska aspekterna. Arbetet inkluderar dataanalys och vetenskaplig slutledning på en internationellt konkurrenskraftig nivå relaterat till evolutionära processer såsom positiv/negativ/diversifierande/balanserande selektion, evolution av repetitivt innehåll och genomstorlek, polyploidi och helgenomduplikation, och genomisk arkitektur av sex. Du förväntas att effektivt kunna utnyttja data från både annoterade genom och helgenom re-sekvensering för att analysera variation inom och mellan arter.
Din framtida arbetsplatsDu kommer att arbeta vid Institutionen för Cell och Molekylärbiologi, vid det Biomedicinska Centret i Uppsala, Sverige. National Bioinformatics Infrastructure Sweden (NBIS) är en stor nationell infrastruktur i snabb utveckling som tillhandahåller avancerad support, verktyg och utbildning till forskarsamhället inom livsvetenskaperna i Sverige. NBIS utgör bioinformatikplattformen på SciLifeLab, och har över 100 anställda personer över hela Sverige, varav 60 seniora bioinformatiker som arbetar inom våra support-team. Som medarbetare inom NBIS Support kommer du att tillhandahålla avancerade analyser till några av de mest vetenskapligt intressanta projekten i Sverige. Exempel på områden som stöds sträcker sig från translationell medicin och komplexa sjukdomar till grundläggande cellbiologi, evolution och miljöforskning. Vi utökar nu vår kapacitet inom evolutionär och jämförande genomik, och populationsgenomik, med ett särskilt fokus på genomik i barrträd.
Arbetet kommer att innebära ett visst mått av resande, eftersom kunskapsutbyte är en viktig del av vår verksamhet för att bibehålla spjutspetsexpertis för analys av befintliga och nya datatyper.

Kvalifikationskrav

Vi eftersöker kandidater som har
(i) ha en doktorsexamen eller motsvarande relevant arbetslivserfarenhet inom bioinformatik eller datavetenskap, inom antingen akademin eller industri
(ii) minst fem år av dokumenterad erfarenhet av att genomföra avancerade vetenskapliga evolutionära, jämförande och/eller populationsgenetiska analyser på storskaliga dataset
(iii) förmåga att självständigt genomföra dataanalys och vetenskaplig slutledning på en internationellt konkurrenskraftig nivå rörande evolutionära processer i eukaryoter, baserat på annoterade genom och data från helgenom re-sekvensering
(iv) skicklighet i att arbeta i en terminalbaserad Linux-miljö och i avancerad skriptprogrammering i ett relevant skriptspråk (t.ex. Python, Perl eller R)
(v) förmåga att uttrycka sig flytande på engelska i tal och skrift
(vi) god förmåga att samarbeta och kommunicera med andra personer

Önskvärt/meriterande i övrigt

Postdoktorala studier är en stark merit men inte ett krav. Vi tror att du har ett starkt intresse för växtgenomik och evolution. Erfarenhet från att arbeta med stora dataset, och arbete med komplexa repetitiva genom, inklusive mobila genetiska element, är också en merit. Starka färdigheter i experimentell design och mjukvaruutveckling är också meriterande. ”Reproducerbar forskning” och ”FAIR data” är centrala koncept för oss, och expertis i utveckling av reproducerbar kod genom användande av koddelningsplattformar, arbetsflödesspråk, och containerlösningar är en stark merit.

Din ansökan ska innehålla:

  • CV med publikationslista
  • Ett personligt brev med motivering till varför du vill arbeta i detta team
  • Kontaktuppgifter till två referenser

Om anställningen

Anställningen är tillsvidare provanställning kan tillämpas Omfattningen är 100 %. Tillträde 15 september, eller enligt överenskommelse. Placeringsort: Uppsala
Upplysningar om anställningen lämnas av: Björn Nystedt, NBIS Support Manager, tel +46 18 471 44 13, bjorn.nystedt@scilifelab.se
Välkommen med din ansökan senast den 15 augusti 2022, UFV-PA 2022/2356.
Vi undanber oss erbjudanden om rekryterings- och annonseringshjälp.
Ansökan tas emot i Uppsala universitets rekryteringssystem.
Placering: Uppsala universitet, Institutionen för cell- och molekylärbiologi
Anställningsform: Heltid , Tillsvidareanställning
Lön: Individuell lönesättning
Antal lediga befattningar: 1
Sysselsättningsgrad: 100%
Ort: Uppsala
Län: Uppsala län
Land: Sverige
Facklig företrädare: Seko Universitetsklubben seko@uadm.uu.se
ST/TCO tco@fackorg.uu.se
Saco-rådet saco@uadm.uu.se
Referensnummer: UFV-PA 2022/2356
Sista dag för ansökan: 2022-08-15 Sök jobbet

Vergiss nicht anzugeben, dass dieses auf Graduateland gefunden hast.